夏も終わりかけの幻想郷。しかし、突如として黒い渦が現れた。それを見たものはブラックホールなどと言い、幻想郷は混乱に陥った。
魔理沙に発明品を届けるために洩矢神社に向かったにとり。そこで霊夢や早苗に会って…